藏民与蒙人倒下的速度，超过了他们前进的速度，在他们冲到城门口之前，已经全部倒下了，城门就在眼前，借助燧发枪射击时微弱的火光，他们还能看到西城门，几乎一伸手就可以推开，但他们永远失去了推开西城门的机会。

&esp;&esp;明军开始屠杀受伤的百姓，特别是原来把守城门的那个营，只要士兵还有一点力气，都会跑过砍上几刀。

&esp;&esp;林呈祥也来到西城门，黑暗中已经看不清地上的尸体，他本来没准备屠城，只是希望驱逐藏民与蒙人，缩减城内的非汉族人口，当听说城门口的明军出现伤亡时，一向温文尔雅的林呈祥也是动怒了：“屠城。”

&esp;&esp;城内再次陷入混乱，士兵挨家挨户搜查，见人就杀，见物就抢，连寺庙也未能幸免。

&esp;&esp;这次屠城，不仅让城内的藏民与蒙人被残杀一空，还搜得黄金及器物五万六千多两，白银二十三万多两。

&esp;&esp;林呈祥原本准备在城内留守一个旅的兵力，但城外的骑兵决战，让他损失两千骑兵，还有两千骑兵重伤，需要在城内养伤，他最后留下一个团的兵力。

&esp;&esp;临走之前候，他给团长额外留下一千把马刀：“不论你用什么方法，允许有大量的淘汰，一个月后，要让一千汉人转化为地方武装，训练结束后，将他们分成两拨，轮流一日为兵，一日为民。”

&esp;&esp;林呈祥又从当地的汉人中，选择一个名叫杨金白的汉人，作为临时的客木知府，又留下两名军中参谋辅佐他处理政务，这才带着大军，往工布的方向追赶沐起元。